Năm 1907, Joplin chuyển đến thành phố New York, ông tin rằng là nơi tốt nhất để tìm một nhà sản xuất cho một vở opera mới. Sau khi anh chuyển tới New York, Joplin gặp Lottie Stokes, người ông kết hôn vào năm 1909. [40] Năm 1911, không thể tìm thấy một nhà xuất bản, Joplin đảm nhận gánh nặng tài chính của xuất bản Treemonisha mình ở định dạng đàn piano thanh nhạc. Trong năm 1915, như một nỗ lực cuối cùng để nhìn thấy nó thực hiện, ông đã mời một khán giả nhỏ nghe nó tại một phòng tập ở Harlem. Kém dàn dựng và chỉ với Joplin vào đệm đàn piano, đây là "một thất bại đau khổ" tới công chúng chưa sẵn sàng cho "thô" các hình thức như vậy âm nhạc da đen khác nhau từ các vở opera lớn của châu Âu thời điểm đó. [44] Các khán giả, kể cả những người ủng hộ tiềm năng, thờ ơ và bước ra ngoài. [39] Scott viết rằng "sau màn trình diễn single tai hại... Joplin bị suy nhược. Ông đã bị phá sản, khuyến khích, và kiệt sức." Ông kết luận rằng vài nghệ sĩ Mỹ trong thế hệ của ông phải đối mặt với những trở ngại như: ". Treemonisha đi không được chú ý và chưa được xem xét, phần lớn là vì Joplin đã từ bỏ âm nhạc thương mại nghiêng về nghệ thuật âm nhạc, một lĩnh vực đóng cửa để người Mỹ gốc Phi" [28] Trong thực tế, nó không phải là cho đến những năm 1970 rằng opera nhận được một dàn sân khấu đầy đủ.

Năm 1914, Joplin và Lottie tự xuất bản "Rag Magnetic" của mình là Công ty Âm nhạc Scott Joplin, mà ông đã hình thành trong tháng 12 trước đó. [45] Người viết tiểu sử Vera Brodsky Lawrence đoán rằng Joplin đã nhận thức được sự suy giảm tiến của mình do bệnh giang mai và đã "... có ý thức chạy đua với thời gian." Trong ghi chú tay áo của mình về việc phát hành 1.992 Deutsche Grammophon của Treemonisha bà ghi nhận rằng ông "... rơi luống cuống vào nhiệm vụ dàn opera, ngày và đêm của mình, với người bạn của ông Sam Patterson đứng để sao chép ra các bộ phận, từng trang, vì mỗi trang của các điểm số đầy đủ đã được hoàn thành. "[46]

Năm 1916, Joplin đã mắc bệnh giang mai. [47] [48] Vào tháng 1 năm 1917, ông được nhận vào bệnh viện nhà nước Manhattan, một bệnh viện tâm thần. [49] Ông mất ở đó vào ngày 01 tháng 4 của bệnh mất trí nhớ syphilitic ở tuổi 49 [44] [50] và được chôn trong ngôi mộ của một người nghèo mà vẫn không đánh dấu 57 năm. Mộ của ông ở Saint Michaels Nghĩa trang ở Đông Elmhurst cuối cùng đã được đưa ra một đánh dấu vào năm 1974, năm mà The Sting, trong đó giới thiệu âm nhạc của mình, dành cho phim hay nhất tại giải Oscar. [51]